簡介:

mpiBLAST是一開放原始碼的平行化BLAST程式,mpiBLAST將資料庫切割,並將切割後的數個子資料庫分派給計算叢集中的每個節點,每個節點均被分到一個唯一的子資料庫。資料庫分割後,讓每個節點只需搜尋資料庫中較小的子集,期望能將所需搜尋的資料全部都能存於記憶體(RAM)中,減少磁碟存取(disk I/Odisk I/O耗費的時間遠大於RAM存取的時間),以增加BLAST的效能。

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