- Oct 27 Tue 2009 16:22
本站簡介
- Dec 02 Wed 2009 14:13
系統發生樹(演化樹)工具匯整網站
最近在處理一些系統發生樹(演化樹)的問題,用了一些傳統畫樹的工具,怎麼畫怎麼覺得醜,無意中發現有個不錯的網站搜集並整理了許多演化樹相關的工具,讓大家在處理演化樹時能有更多的選擇了。
- Nov 20 Fri 2009 12:04
MEME Suit
MEME Suit是一個發掘DNA與蛋白質motif、TFBS (transcription factor binding site)的網頁程式,網址為: http://meme.nbcr.net。
- Nov 06 Fri 2009 10:00
SNP偵測工具-inGAP
- Nov 04 Wed 2009 23:30
Perl
Perl是生物資訊常用到的工具之一,因為在網路上還滿容易找到相關資料的,所以在此沒有特別撰寫專文說明,如果各位有特別的問題,可以提出來大家討論討論,我再針對問題回覆。
- Nov 04 Wed 2009 12:52
Rocks Cluster
待續
- Nov 04 Wed 2009 11:30
mpiBLAST之建置與效能評估
簡介:
mpiBLAST是一開放原始碼的平行化BLAST程式,mpiBLAST將資料庫切割,並將切割後的數個子資料庫分派給計算叢集中的每個節點,每個節點均被分到一個唯一的子資料庫。資料庫分割後,讓每個節點只需搜尋資料庫中較小的子集,期望能將所需搜尋的資料全部都能存於記憶體(RAM)中,減少磁碟存取(disk I/O,disk I/O耗費的時間遠大於RAM存取的時間),以增加BLAST的效能。
- Nov 04 Wed 2009 11:28
在JBuilder上安裝Jython
在JBuilder上安裝Jython
從http://www.jython.org/Project/index.html下載jython。
下載完成後,請先進入cmd,然後進入安裝檔所在的目錄下,鍵入java -jar jython_installer-2.x.x.jar。
- Nov 04 Wed 2009 11:27
SAM-Significance Analysis of Microarrays
SAM(Significance Analysis of Microarrays)是一種用來尋找microarray中顯著基因的統計工具,是由VB撰寫而成的Excel增益功能,由於該程式是用VB寫的,所以目前只有Windows版本可用,其它作業系統還沒有支援。在Office的版本上,也只支援到2007以前的版本,雖然在Office 2007上可以安裝成功,但是卻無法使用。
- Nov 04 Wed 2009 11:26
在bioconductor中讀取gpr檔發生錯誤的解決方案